1994年集中歸并了原分散在二局一、二、三、四隊和地質礦產研究所的主要地勘技術人員、地質資料-礦權資產，組建“冶金工業部第二地質勘查局地質礦產開發院 ”，院部設在原“冶金工業部地質勘查總局二局地質礦產研究所”所在地：福建莆田市涵江區。

      2001年初，單位名稱變更為“中國冶金地質勘查工程總局第二地質勘查院”；

      2006年8月，經國務院國資委批準，“中國冶金地質勘查工程總局”更名為“中國冶金地質總局”，我院作為下屬單位名稱相應變更為“中國冶金地質總局第二地質勘查院”。